微生物菌劑之所以能改善土壤狀況，是因?yàn)樗啥喾N有益菌組成，使土壤有益菌迅速繁殖，增加有益菌群數(shù)量，解決土壤板結(jié)、重茬問題，改善土壤環(huán)境。具有“保水、增肥、透氣”性能，疏松土壤、提高透氣性、降低容重，提高幾丁質(zhì)酶含量，活化土層，增強(qiáng)肥水滲透力。
微生物在土壤中物質(zhì)和能量的輸入輸出中扮演著非常重要的角色，是物質(zhì)循環(huán)鏈上的重要環(huán)節(jié)，它能夠活化土壤有機(jī)與無機(jī)養(yǎng)分，分解有機(jī)物，釋放養(yǎng)分，增加養(yǎng)分的有效性。當(dāng)前土壤中出現(xiàn)的板結(jié)、酸化、鹽漬化、土壤貧瘠、地力衰竭等問題出現(xiàn)的原因肥料在土壤中長(zhǎng)期積累、殘存、得不到有效分解和營(yíng)養(yǎng)轉(zhuǎn)化，而養(yǎng)分的釋放和轉(zhuǎn)化正是靠微生物。
微生物通過代謝過程中氧氣和二氧化碳的交換以及分泌的有機(jī)酸等酸性物質(zhì)，促進(jìn)土壤中微量元素的釋放及螯合，有效打破土壤板結(jié)，促進(jìn)團(tuán)粒結(jié)構(gòu)的形成，并能改善土壤的通氣狀況，促進(jìn)有機(jī)質(zhì)、腐殖酸和腐殖質(zhì)的生成。對(duì)應(yīng)于當(dāng)前土壤中出現(xiàn)的通透性不強(qiáng)、保水保肥性差、地力差等問題，正是受土壤中的團(tuán)粒結(jié)構(gòu)、有機(jī)質(zhì)、腐殖酸和腐殖質(zhì)的影響，而這些物質(zhì)的形成又受土壤中微生物的作用。